El Ministerio de Educación ordenó abrir una investigación preliminar a la Universidad Popular del Cesar por una supuesta violación a las normas de tipo legal y estatutario; directamente a la inobservancia del reglamento interno del Consejo Superior Universitario y el Estatuto General de la Universidad.
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Dicha investigación se da a través de la Resolución Nº 022462 del 1 de diciembre de 2020, como respuesta a la queja presentada por la delegada del presidente de la República ante el Consejo Superior Universitario, Jackeline Marlyory González Padilla, al advertir de supuestas irregularidades dentro del claustro universitario, al convocar y celebrar sesiones extraordinarias por parte del CSU sin cumplir con las disposiciones normativas vigentes y aplicables.
